"Angewandte Bioinformatik in den Molekularen Biowissenschaften" (12 C, 14 SWS) [M.Bio.105]

Lernziele, Kompetenzen:
Die Studierenden setzen sich mit Programmen und Datenbanken zur datengetriebenen Omics-basierten Forschung auseinander, die es ermöglichen, wichtige Fragestellungen
der modernen Biologie zu bearbeiten. Besondere inhaltliche Schwerpunkte sind:
• Die Anwendung der Bioinformatik in der molekularen Phylogenie, Evolution,
Genomdynamik und (Meta)Omics
• Bioinformatische Analysen von RNAs und Proteinen
• Motiverkennung und Genidentifizierung
• Erstellung und Bearbeitung von Stoffwechselmodellen und -netzwerken
Im Mittelpunkt steht die Analyse, Visualisierung und Integration der großen Datenmengen, die Omics- Technologien (z.B. Genomik, Transkriptomik, Proteomik, und
Metabolomik) generieren und die Grundlagen für ein systembiologisches Verständnis von Organismen und Gemeinschaften bilden.


Lehrveranstaltungen und Prüfungen
1. Vorlesung: Angewandte Bioinformatik in den molekularen Biowissenschaften( (2 SWS)
2. Seminar: Angewandte Bioinformatik( (1 SWS)
3. Blockpraktikum: Angewandte Bioinformatik in den molekularen Biowissenschaften (10 SWS)

Modulprüfung:
mündlich: Präsentation (ca. 30 Minuten) zu Methoden und Ergebnissen des Praktikums [80% der Gesmatnote] und Seminarvortrag (ca. 15 Minuten) [20% der Gesamtnote]

Prüfungsanforderungen:
Kenntnisse in Anwendungen bioinformatischer Methoden mit Schwerpunkten in (Meta)Omics basierten Analysen, Motiverkennung und Modellierung von
Stoffwechselleistungen. Fähigkeit, wissenschaftliche Publikationen reflektierend zu präsentieren.

Prüfungsvorleistung:
regelmäßige Teilnahme, testiertes Protokoll oder Manuskript

Wahlmöglichkeiten
Wahlpflichtmodul

Zugangsvoraussetzungen
Linux-Kenntnisse, B.Bio-NF.117 oder vergleichbares
empfohlen: Python und R-Kenntnisse

Wiederholbarkeit
Zweimalig

Angebotshäufigkeit
Jedes Wintersemester

Dauer
Das Modul kann in einem Semester abgeschlossen werden.

Sprache
Englisch

Maximale Studierendenzahl
12

Workload: 360 h ( 196/ 164 h, Präsenzzeit/Selbststudium)

Modulkoordinator/in
Prof. Dr. Rolf Daniel