Ecoinformatics, Biometrics and Forest Growth

Dr. M.Sc., Dipl.-Betrw. (FH) Jan C. Thiele




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Logo Abteilung Ökoinformatik, Biometrie und Waldwachstum
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Research topics


Teaching

WiSe:

  • Advanced data analysis (700122), Masters course, 4 hours per week per semester, 6 Credits


SoSe:

  • Geographic Informationsystems (700181), Bachelors course, 2 hours per week per semester, 3 Credits


Publications

    • Thiele, J.C.; Nuske, R.S.; Ahrends, B.; Panferov, O.; Albert, M.; Staupendahl, K.; Junghans, U.; Jansen, M.; Saborowski, J. (2017): Climate change impact assessment - A simulation experiment with Norway spruce for a forest district in Central Europe. Ecological Modelling 346: 30-47.
    • Railsback, S.; Ayllón, D.; Berger, U.; Grimm, V.; Lytinen, S.; Sheppard, C.; Thiele, J. (2017): Improving Execution Speed of Models Implemented in NetLogo. Journal of Artificial Societies and Social Simulation 20 (1) 3 http://jasss.soc.surrey.ac.uk/20/1/3.html.
    • Thiele, J. C.; Nuske, R. S. (2016): Design and implementation of a web-based decision support system for climate change impact assessment of forests. Forstarchiv 87(1) S. 11-23.
    • Thiele, J.C.; Grimm, V. (2015): Replicating And Breaking Models: Good for You and Good for Ecology. OIKOS 124 (6): 691-696.
    • Thiele, J. C.; Busch, G. (2015): A Decision Support System to Link Stakeholder Perception with Regional Renewable Energy Goals for Woody Biomass, in Bioenergy from Dendromass for the Sustainable Development of Rural Areas (eds D. B. Manning, A. Bemmann, M. Bredemeier, N. Lamersdorf and C. Ammer), Wiley-VCH, Weinheim, Germany.
    • Busch, G.; Thiele, J. C. (2015): The Bioenergy Allocation and Scenario Tool (BEAST) to Assess Options for the Siting of Short Rotation Coppice in Agricultural Landscapes: Tool Development and Case Study Results from the Göttingen District, in Bioenergy from Dendromass for the Sustainable Development of Rural Areas (eds D. B. Manning, A. Bemmann, M. Bredemeier, N. Lamersdorf and C. Ammer), Wiley-VCH, Weinheim, Germany.
    • Thiele, J.C.; Kurth, W.; Grimm, V. (2014): Facilitating Parameter Estimation and Sensitivity Analysis of Agent-Based Models: A Cookbook Using NetLogo and R. Journal of Artificial Societies and Social Simulation 17 (3) 11 http://jasss.soc.surrey.ac.uk/17/3/11.html.
    • Thiele, J.C.; Kurth, W.; Grimm, V. (2014): Facilitating Parameter Estimation and Sensitivity Analysis of Agent-Based Models: A Cookbook Using NetLogo and R. Journal of Artificial Societies and Social Simulation 17 (3) 11 http://jasss.soc.surrey.ac.uk/17/3/11.html.
    • Thiele J.C. (2014): R Marries NetLogo: Introduction to the RNetLogo Package. Journal of Statistical Software 58(2): 1-41. URL http://www.jstatsoft.org/v58/i02/.
    • Tölle, M.H.; Gutjahr, O.; Busch, G.; Thiele, J.C. (2014): Increasing Bioenergy Production on Arable Land - Does the Regional and Local Climate Respond? Germany as a Case Study. Journal of Geophysical Research: Atmospheres 119 (6): 2711-2724.
    • Thiele, J.C.; Kurth, W.; Grimm, V. (2012): Agent-Based Modelling: Tools for Linking NetLogo and R. Journal of Artificial Societies and Social Simulation 15 (3) 8 <http://jasss.soc.surrey.ac.uk/15/3/8.html>.
    • Thiele, J.C.; Kurth, W.; Grimm, V. (2012): RNetLogo: An R Package for Running and Exploring Individual-Based Models Implemented in NetLogo. Methods in Ecology and Evolution 3 (3): 480-483. full text access
    • Nuske. R.S.; Thiele, J.C. (2012): (Geo-) Datenmanagement für nachhaltiges Landmanagement. In: Clasen, M.; Fröhlich, G., Bernhardt, H., Hildebrand, K., Theuvsen, B. (Eds): Informationstechnologie für eine nachhaltige Landbewirtschaftung, Gesellschaft für Informatik, Lecture Notes in Informatics 194, pp. 211-214.
    • Nuske. R.S.; Thiele, J.C. (2012): GeoNetwork OpenSource: From Index Cards to Spatial Data Infrastructures. EarthZine IEEE. http://earthzine.org
    • Thiele, J.C.; Kurth, W.; Grimm, V. (2011): Agent- and Individual-Based Modeling with NetLogo: Introduction and new NetLogo Extensions. In: Deutscher Verband Forstlicher Forschungsanstalten, Sektion Forstliche Biometrie und Informatik - 22. Tagung, 68-101. manuscript as pdf
    • Panferov, O.; Ahrends, B.; Nuske, R.S.; Thiele, J.C.; Jansen, M. (2011): Challenges in Climate-Driven Decision Support Systems in Forestry, In: C. Jao (Ed): Efficient Decision Support Systems - Practice and Challenges in Multidisciplinary Domains, InTech, pp. 459-478.
    • Thiele, J.C.; Nuske, R.S.; Schleich, S. (2010): gvSIG - bereit für die Praxis? AFZ-Der Wald (11), pp. 32-33.
    • Nuske, R.S.; Thiele, J.C.; Burggraef, L.S. (2010): Quantum GIS. AFZ-Der Wald (11), pp. 30-31.
    • Thiele, J.C.; Grimm, V. (2010). NetLogo Meets R: Linking Agent-Based Models with a Toolbox for Their Analysis. Environmental Modelling and Software, Volume 25, Issue 8: 972 - 974 [DOI: 10.1016/j.envsoft.2010.02.008]. at ScienceDirect
    • Thiele, J.C.; Nuske, R.S.; Ahrends, B.; Saborowski, J. (2009): Entwicklung eines Entscheidungsunterstützungssystems für die Waldbewirtschaftung unter sich ändernden Klimabedingungen. In: Mahammadzadeh, M; Biebeler, H; Bardt, H: Klimaschutz und Anpassung an die Klimafolgen. Institut der deutschen Wirtschaft Köln Medien GmbH. Köln. pp. 303-310.
    • Nuske, R.S.; Thiele, J.C. (2009): GeoNetwork - der digitale Kartenschrank, AFZ-Der Wald (6) 16. März 2009, pp. 293 - 295.
    • Thiele, J.C.; Lanwert, D. (2009): E-Assessment - Erfahrungen aus der Praxis am Beispiel "Raumbezogene Informationssysteme", Sektion Forstliche Biometrie und Informatik - Die Grüne Reihe, ISSN 1860-4064, pp. 9 - 19.
    • Thiele, J.C.; Nuske, R.S. (2008): Einsatzmöglichkeiten von Wikis im Forstsektor: Mit Hilfe von Wikis vom
      Wissen aller Mitarbeiter profitieren, AFZ-Der Wald (18) 15. Sep. 2008, pp. 974 - 976.
    • Jansen, M.; Döring, C.; Ahrends, B.; Bolte, A.; Czajkowski, T.; Panferov, O.; Albert, M.; Spellmann, H.;
      Nagel, J.; Lemme, H.; Habermann, M.; Staupendahl, K.; Möhring, B.; Böcher, M.; Storch, S.; Krott, M.; Nuske, R.; Thiele, J.C.; Nieschulze, J.; Saborowski, J.; Beese, F. (2008): Anpassungsstrategien für eine nachhaltige Waldbewirtschaftung unter sich wandelnden Klimabedingungen - Entwicklung eines Entscheidungsunterstützungssystems "Wald und Klimawandel" (DSS-WuK), Forstarchiv, pp. 131 - 142.
    • Thiele, J.C. (2008): Beispielhafte Anwendung von zwei heuristischen Methoden der Tourenplanung für eine imaginäres Zellstoffwerk, Allg. Forst- und Jagdzeitung (2/3), pp. 33 - 42.


Thesis and reports

  • Thiele, J.C. (2015): Towards Rigorous Agent-Based Modelling. Linking, Extending, and Using Existing Software Platforms, Dissertation, Faculty of Mathematics and Informatics, University of Göttingen, 314 p. pdf
  • Thiele, J.C.; Nuske, R.S.; Ahrends, B.; Jansen, M.; Saborowski, J.; Albert, M.; Nagel, J.; Junghans, U.; Czajkowski, T.; Panferov, O.; Staupendahl, K.; Spellmann, H.; Habermann, M.; Bolte, A.; Möhring, B. (unveröffentl.): Abschätzung der abiotischen und biotischen Risiken für die Fichte im Arnsberger Wald unter veränderten Klimabedingungen -DSS-WuK Arnsberger Wald -, Final Report, Göttingen, Januar 2010, internal Report, 72 p.
  • Thiele, J.C. (2007): Ein individuenbasiertes Modell zur Populationsdynamik von Daphnia magna in Laborexperimenten. Master Thesis, Faculty of Forest Sciences and Forest Ecology, University of Göttingen, 179 p.
  • Thiele, J.C. (2005): Global Entrepreneurship - Rahmenbedingungen für Existenzgründungen in der EU und den USA. Diploma Thesis, Faculty of Economics, University of Applied Sciences Bremen, 322 p. pdf